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SUMMARY: NESTED | FIELD | CONSTR | METHOD | DETAIL: FIELD | CONSTR | METHOD |
java.lang.Objectgov.nih.nci.lexbig.ext.DLBWrapper
public class DLBWrapper
DLBWrapper
Field Summary | |
---|---|
static java.lang.String |
ASSOCIATION_RELATION
A constant String with a value "associations" |
protected java.lang.String |
codingScheme
active coding scheme name |
CodingSchemeRenderingList |
csrl
an instance of CodingSchemeRenderingList |
protected CodingScheme |
defaultCodingScheme
|
org.LexGrid.LexBIG.Utility.ConvenienceMethods |
lbConvMethods
an instance of org.LexGrid.LexBIG.Utility.ConvenienceMethods |
protected org.LexGrid.LexBIG.LexBIGService.LexBIGService |
lbSvc
|
static int |
RESTRICT_TO_SOURCE
A constant equaling 2. |
static int |
RESTRICT_TO_TARGET
A constant equaling 1. |
static java.lang.String |
ROLE_RELATION
A constant String with a value "roles" |
static java.lang.String |
ROOT_ASSOCIATION
A constant String with a value "owl:AnnotationProperty" |
static java.lang.String |
ROOT_ROLE
A constant String with a value "owl:ObjectProperty" |
protected java.util.Vector<CodingScheme> |
supportedCodingSchemes
A vector containing the name of all supported coding schemes. |
protected java.lang.String |
tag
|
static java.lang.String |
TYPE_COMMENT
A static String with a value "comment" |
static java.lang.String |
TYPE_DEFINITION
A static String with a value "definition" |
static java.lang.String |
TYPE_INSTRUCTION
A static String with a value "instruction" |
static java.lang.String |
TYPE_PRESENTATION
A static String with a value "presentation" |
static java.lang.String |
TYPE_PROPERTY
A static String with a value "property" |
protected java.lang.String |
version
|
Constructor Summary | |
---|---|
DLBWrapper()
Creates a new DLBWrapper instance from org.LexGrid.service.Service and LexBIGService parameters |
|
DLBWrapper(EVSApplicationService lbSvc)
|
Method Summary | |
---|---|
java.lang.Boolean |
areAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code1,
java.lang.String code2,
boolean direction,
java.lang.String associationName)
|
java.lang.Boolean |
areAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code1,
java.lang.String code2,
boolean direction,
java.lang.String associationName)
|
java.lang.Boolean |
areCodesRelated(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code1,
java.lang.String code2,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
array2Vector(java.lang.String[] a)
|
protected java.util.Vector |
arrayToVector(java.lang.Object[] objects)
Converts an array of objects to a vector of objects |
protected LocalNameList |
atributeSetDescriptorIndex2LocalNameList(int ASD_Index)
|
java.lang.Boolean |
codeExists(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.lang.String |
codeToName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
Convert an NCI concept code to a concept name. |
java.lang.String |
codeToName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String code)
|
java.lang.String |
codeToName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version_in,
java.lang.String tag_in,
java.lang.String code)
|
static java.util.Vector<Role> |
conceptAssociations2Roles(java.util.Vector<ConceptAssociation> asso)
|
boolean |
conceptExists(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
protected java.lang.Boolean |
conceptExists(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
boolean activeOnly,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<Property> |
convertProperties(org.LexGrid.commonTypes.Property[] properties)
|
protected CodedNodeSet |
createCodeNodeSet(java.lang.String[] conceptCodes,
java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
CodingSchemeVersionOrTag |
createCodingSchemeVersionOrTag(java.lang.String version,
java.lang.String tag)
Creates a CodingSchemeVersionOrTag instance for a given version and a tag |
static ConceptReference |
createConceptReference(java.lang.String code,
java.lang.String codingSchemeName)
Creates a ConceptReference instance corresponding to a given coding scheme name and a concept code. |
static ConceptReferenceList |
createConceptReferenceList(java.lang.String[] codes,
java.lang.String codeSystem)
|
NameAndValue |
createNameAndValue(java.lang.String name,
java.lang.String value)
Creates a NameAndValue instance for a given name and value pair. |
protected NameAndValueList |
createNameAndValueList(java.lang.String[] names,
java.lang.String[] values)
|
static CodingSchemeVersionOrTag |
createProductionTag()
|
static SortOption |
createSortOption(java.lang.String sortExtensionName,
java.lang.Boolean ascending)
|
static SortOptionList |
createSortOptionList(java.lang.String[] sortExtensionNames)
|
static SortOptionList |
createSortOptionList(java.lang.String[] sortExtensionNames,
java.lang.Boolean[] ascending)
|
protected java.lang.String |
dateToString(java.util.Date aDate)
|
java.util.Vector |
findCodedEntriesWithAssociation(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String associationName,
java.lang.String matchAlgorithm,
int maxToReturn)
|
java.util.Vector |
findCodedEntriesWithAssociationMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String matchText,
java.lang.String associationName,
java.lang.String matchAlgorithm,
int maxToReturn)
|
java.util.Vector |
findCodedEntriesWithAssociationMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String matchText,
java.lang.String associationName,
java.lang.String matchAlgorithm,
int maxToReturn,
int restriction_direction)
|
java.util.Vector |
findCodedEntriesWithAssociationMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String matchText,
java.lang.String associationName,
java.lang.String matchAlgorithm,
int maxToReturn,
int restriction_direction,
java.util.Vector restricted_property_vec)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
findCodedEntriesWithAssociationMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String matchText,
java.lang.String associationName,
java.lang.String matchAlgorithm,
int maxToReturn,
int restriction_direction,
java.util.Vector restricted_property_vec,
java.lang.String relationName)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
findCodedEntriesWithDesignationMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String matchText,
boolean preferredOnly,
java.util.Vector sortByProperty_vec,
java.util.Vector source_vec,
java.lang.String matchAlgorithm,
int maxToReturn)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
findCodedEntriesWithPropertyMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String matchText,
java.util.Vector property_vec,
java.util.Vector restrictToProperties_vec,
java.lang.String matchAlgorithm,
int maxToReturn)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
findCodedEntriesWithPropertyMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String matchText,
java.util.Vector property_vec,
java.util.Vector restrictToProperties_vec,
java.lang.String matchAlgorithm,
int maxToReturn,
java.lang.String language)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
findCodedEntriesWithSourceCodeMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String sourceAbbr,
java.lang.String code,
int maxToReturn)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
findCodedEntriesWithSourceCodeMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String sourceAbbr,
java.lang.String code,
int maxToReturn)
|
protected CodedEntry |
findCodedEntryWithNameMatching(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String name)
|
java.lang.String |
findConceptNameByCode(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String code)
|
protected java.lang.String |
findDescription(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
Returns the entity description for a given code, or the code if no description can be located. |
java.util.Vector<java.lang.String> |
findRelatedCodes(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.lang.String relation,
boolean direction)
|
java.util.Vector |
getAllAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String code,
boolean direction)
|
protected java.util.Vector<CodedEntry> |
getAllConcepts(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
boolean activeOnly,
java.util.Vector sortproperties,
java.util.Vector properties,
int maxToReturn)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getAncestorCodeActionDates(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode,
java.util.Date iBaselineDate_in,
java.util.Date fBaselineDate_in)
|
java.util.Vector |
getAncestorCodes(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode,
boolean atBaseline,
java.util.Date iBaselineDate_in,
java.util.Date fBaselineDate_in)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getAncestorCodes(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode,
boolean atBaseline,
java.util.Date iBaselineDate_in,
java.util.Date fBaselineDate_in,
boolean split_merge_only)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getAncestors(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
boolean direction,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String relationship,
java.lang.String association,
java.lang.String conceptCode,
boolean direction,
boolean buildReferencedEntries)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
boolean direction,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
boolean direction,
java.lang.String associationName,
int resolveAssociationDepth,
int resolveCodedEntryDepth)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
getAssociatedCodedEntriesBySource(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
boolean direction,
java.lang.String associationName,
int resolveAssociationDepth,
int resolveCodedEntryDepth,
java.lang.String sourceAbbr)
|
java.util.Vector |
getAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.lang.String relation)
|
java.util.Vector<AssociatedConcept> |
getAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.lang.String relation,
boolean direction)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getAssociationNames(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
boolean direction)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getAssociationNamesByRelation(CodingScheme cs,
java.lang.String relation)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getAssociationNamesByRelation(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String relationName)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
getAssociationSources(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector |
getAssociationSources(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector |
getAssociationTargets(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector |
getAssociationTargets(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getAvailableCodingSchemeTags(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getAvailableCodingSchemeVersions(java.lang.String codingSchemeName)
Gets available coding scheme versions for a given CodingScheme |
int |
getChangeTypeNumber(java.lang.String s)
|
protected int |
getChildCount(java.util.HashMap HashMap,
java.lang.String code)
|
protected Association[] |
getChildrenOf(java.lang.String conceptCode,
java.lang.String relationship,
java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
boolean buildReferencedEntries)
|
protected int |
getCNGSize(CodedNodeGraph cng)
|
protected int |
getCNSSize(CodedNodeSet cns)
|
java.util.Vector |
getCodeActionChildren(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode,
java.util.Date baselineDate_in)
|
java.util.Vector |
getCodeActionParents(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode,
java.util.Date baselineDate_in)
|
CodedEntry |
getCodedEntry(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
CodedEntry |
getCodedEntry(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
int ASD_Index)
|
CodedEntry |
getCodedEntryByCode(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
CodedEntry |
getCodedEntryByName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String name)
|
protected java.util.Vector<java.lang.String> |
getCodedEntrySources(CodedEntry ce)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getCodesInCodedEntries(java.util.Vector w)
|
CodingScheme |
getCodingScheme(java.lang.String codingScheme)
Gets CodingScheme instance for a given coding scheme name. |
CodingScheme |
getCodingScheme(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version)
Gets CodingScheme instance for a given coding scheme name and version. |
CodingScheme |
getCodingScheme(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
Gets CodingScheme instance for given coding scheme name, version, and tag |
CodingSchemeSummary |
getCodingSchemeSummary(java.lang.String codingSchemeName)
|
CodingSchemeSummary |
getCodingSchemeSummary(java.lang.String codingSchemeName,
java.lang.String version)
|
protected CodingSchemeVersion |
getCodingSchemeVersion(CodingScheme cs,
java.lang.String version)
Gets the instance of CodingSchemeVersion given an instance of CodingScheme and a version number. |
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String conceptCode,
boolean direction)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String conceptCode,
boolean direction,
boolean returncode)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String conceptCode,
boolean direction,
boolean returncode,
boolean forTreeTraversal)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String conceptCode,
boolean direction,
boolean returncode,
boolean forTreeTraversal,
java.lang.String relation)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String conceptCode,
boolean direction,
java.lang.String relation)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<CodingSchemeVersion> |
getConceptChangeVersions(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
CodingSchemeVersion |
getConceptCreateVersion(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.util.Date |
getConceptCreationDate(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<EditActionDate> |
getConceptEditAction(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<java.util.Date> |
getConceptEditActionDates(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
int iAction)
|
java.util.Vector<NCIChangeEvent> |
getConceptHistory(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<NCIChangeEvent> |
getConceptHistory(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
CodingSchemeVersion csv)
|
java.util.Vector<NCIChangeEvent> |
getConceptHistory(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.util.Date beginDate,
java.util.Date endDate)
|
java.lang.String |
getConceptName(java.lang.String codingScheme,
CodedEntry ce)
|
java.lang.String |
getConceptName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String code)
|
protected java.util.Vector<NameAndValue> |
getConceptProperties(CodedEntry ce)
|
java.util.Vector<Property> |
getConceptProperties(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.lang.String propertytype,
java.lang.String propertyname)
|
protected java.util.Vector<CodedEntry> |
getConceptsByKind(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
boolean activeOnly,
java.lang.String kind,
int maxToReturn)
|
java.lang.String |
getConceptStatus(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
java.lang.String |
getCopyRight(CodingScheme cs)
Gets copy right statement for a given CodingScheme |
java.util.Vector<java.lang.String> |
getDescendantCodeActionDates(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode,
java.util.Date iBaselineDate_in,
java.util.Date fBaselineDate_in)
|
java.util.Vector |
getDescendantCodes(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode,
boolean atBaseline,
java.util.Date iBaselineDate_in,
java.util.Date fBaselineDate_in)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getDescendantCodes(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode,
boolean atBaseline,
java.util.Date iBaselineDate_in,
java.util.Date fBaselineDate_in,
boolean merge_split_only)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getDescendants(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String inCode)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getFilterExtensions()
|
java.lang.String |
getHasSubtype(java.lang.String codingSchemeName)
|
java.util.Vector<java.util.Date> |
getHistoryBaselineDates(java.lang.String codingScheme)
|
java.util.Date |
getHistoryEndBaselineDate(java.lang.String codingScheme)
|
java.util.Date |
getHistoryStartBaselineDate(java.lang.String codingScheme)
|
java.util.Vector |
getInverseConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<ConceptAssociation> |
getInverseConceptAssociations(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
java.lang.String |
getInverseName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String relationName,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector |
getInverseRoles(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector |
getInverseRoles(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
Logger |
getLogger()
|
java.lang.String |
getName(CodedEntry ce)
|
java.lang.String |
getName(java.lang.String codingSchemeName,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
protected java.lang.String |
getNativeRelationName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version)
|
java.lang.Integer |
getNumberEditActions(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.util.Date baselineDate_in)
|
java.lang.Integer |
getNumberEditActions(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.util.Date beginDate,
java.util.Date endDate)
|
protected Association[] |
getParentsOf(java.lang.String conceptCode,
java.lang.String relationship,
java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
boolean buildReferencedEntries)
|
java.lang.String |
getPreferredName(CodedEntry ce)
|
java.util.Vector<Property> |
getProperties(CodedEntry ce)
|
java.util.Vector |
getPropertiesByCode(java.lang.String codingSchemeName,
java.lang.String versionName,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<Property> |
getPropertiesByConceptName(java.lang.String codingSchemeName,
java.lang.String versionName,
java.lang.String tagName,
java.lang.String conceptname)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getPropertyNames(CodedEntry ce)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getPropertyNames(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String conceptname)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getPropertySources(org.LexGrid.commonTypes.Property prop)
Gets property sources. |
java.util.Vector<java.lang.String> |
getPropertyValues(CodedEntry ce,
java.lang.String propertyname)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getPropertyValues(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String conceptname,
java.lang.String propertyname)
|
protected CodedEntry |
getReferencedEntry(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
ResolvedConceptReference rcr)
|
protected java.util.Vector<CodedEntry> |
getRelatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
boolean direction,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getRelationNames(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version)
|
java.util.HashSet<java.lang.String> |
getRelationTypesForConcept(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
java.lang.String |
getRepresentsVersion(java.lang.String codingSchemeName)
|
java.util.Vector<Role> |
getRoles(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<Role> |
getRoles(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector<Role> |
getRoles(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector<Role> |
getRoles(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.lang.String associationName)
|
java.util.Vector |
getRootCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
getRootCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String relation,
java.lang.String association)
|
java.lang.String |
getSearchTechniqueDescription(java.lang.String name)
Gets the description of search technique for a given codeing scheme name. |
java.lang.String |
getSemanticTypeCode(java.lang.String name)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSemanticTypeCodes(java.util.Vector names)
|
java.util.HashMap |
getSemanticTypes()
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSourceCollectionbyCode(java.lang.String vocabularyName,
java.lang.String code)
|
java.util.Vector |
getSources(CodingScheme cs)
Gets sources of a given CodingScheme. |
protected java.util.Vector<AssociatedConcept> |
getSources(java.lang.String scheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.lang.String relation,
java.lang.String source)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedAssociationNames(java.lang.String codingScheme)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedAssociationNames(java.lang.String codingSchemeName,
java.lang.String version,
java.lang.String type)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedAssociationQualifier(java.lang.String codingScheme)
|
java.util.Vector<SupportedAssociation> |
getSupportedAssociations()
|
java.util.Vector<SupportedAssociation> |
getSupportedAssociations(CodingScheme cs)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedCodingSchemeNames()
Gets all supported coding scheme names |
java.util.Vector<CodingScheme> |
getSupportedCodingSchemes()
Gets all supported coding schemes |
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedConceptStatus(java.lang.String codingScheme)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedConceptStatus(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
java.util.Vector<SupportedContext> |
getSupportedContext(CodingScheme cs)
|
java.util.Vector |
getSupportedContext(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
int |
getSupportedContextCount(CodingScheme cs)
|
int |
getSupportedContextCount(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
java.util.Vector |
getSupportedContextNames(CodingScheme cs)
|
java.util.Vector<SupportedProperty> |
getSupportedProperties(CodingScheme cs)
|
java.util.Vector<SupportedProperty> |
getSupportedProperties(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedPropertyNames()
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedPropertyNames(CodingScheme cs)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedPropertyNames(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedPropertyQualifier(java.lang.String codingScheme)
|
java.util.Vector |
getSupportedPropertyQualifiers(java.lang.String codingScheme)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedRepresentationalForms(CodingScheme cs)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedRepresentationalForms(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedRoleNames(java.lang.String codingSchemeName)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedRoleNames(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedSearchTechniques()
Gets all supported search techniques |
java.util.Vector<SupportedSource> |
getSupportedSource(CodingScheme cs)
|
java.util.Vector |
getSupportedSource(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getSupportedSourceNames(CodingScheme cs)
|
java.util.Vector |
getSupportedSourceNames(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag)
|
java.util.Vector<SupportedSource> |
getSupportedSources(CodingScheme cs)
|
protected java.util.Set<java.lang.String> |
getTargetNames(ResolvedConceptReferenceList rcrl)
|
protected java.util.Vector<AssociatedConcept> |
getTargets(java.lang.String scheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.lang.String relation,
java.lang.String source)
|
protected CodedNodeGraph |
getTreeFromServer(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.lang.String relationName,
java.util.Vector properties,
java.util.Vector sourcecodes,
java.util.Vector associations,
boolean direction,
int depth)
Concepts tree data from the server. |
java.util.Date |
getVersionDate(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version)
|
java.util.Vector<java.lang.String> |
getVersions(CodingScheme cs)
Gets versions of a given CodingScheme. |
java.lang.String |
getVocabularyVersionByTag(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String tag)
|
java.lang.Boolean |
hasAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String relationship,
java.lang.String association,
java.lang.String conceptCode,
boolean direction)
|
java.lang.Boolean |
hasAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
boolean direction,
java.lang.String associationName)
|
java.lang.Boolean |
hasAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
boolean direction,
java.lang.String associationName)
|
protected java.util.Vector<java.lang.String> |
hashSet2Vector(java.util.HashSet hset)
Converts a HashSet to a Vector |
protected boolean |
hasProperty(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String property)
|
boolean |
hasRelation(java.lang.String codingSchemeName,
java.lang.String relationName)
|
boolean |
hasRelation(java.lang.String codingSchemeName,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String relationName)
|
protected java.lang.String |
iActiontoStr(int actionId)
Extracts an edit action string (for example, 'CREATE') from a edit action constance string (form example, 'EDIT_ACTION_CREATE_STR') corresponding to the specified edit action code. |
boolean |
initializeSemanticTypes()
|
java.lang.Boolean |
isCodeInGraph(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
protected java.lang.Boolean |
isCodeInGraph(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String associationName,
java.lang.String associationQualiferName,
java.lang.String code)
|
java.lang.Boolean |
isCodeRetired(java.lang.String codingSchemeName,
java.lang.String code)
|
java.lang.Boolean |
isCodingSchemeActive(LexBIGService lbSvc,
java.lang.String scheme,
java.lang.String version)
|
java.lang.Boolean |
isConceptActive(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code)
|
java.lang.Boolean |
isConceptActive(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
java.lang.Boolean |
isConceptEdited(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String code,
boolean mrg_splt,
java.util.Date beginDate,
java.util.Date endDate)
|
java.lang.Boolean |
isForwardName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String directionalName)
|
java.lang.Boolean |
isReverseName(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String directionalName)
|
protected boolean |
isRole(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String associationName)
|
boolean |
isValidHistoryDate(java.lang.String codingScheme,
java.util.Date historydate)
|
java.lang.Boolean |
isVersionComplete(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version)
|
java.util.HashSet<java.lang.String> |
LocalNameList2HashSet(LocalNameList list)
Converts a LocalNameList instance to a HashSet |
protected java.util.Vector<java.lang.String> |
mapSynonymsToPreferredNames(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String matchText,
boolean preferredOnly,
java.util.Vector sortByProperty_vec,
int maxToReturn,
java.lang.String matchAlgorithm)
|
java.lang.String |
nameToCode(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String name)
Return the concept code that corresponds to the passed NC_Name |
java.lang.String |
nameToCode(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version_in,
java.lang.String tag_in,
java.lang.String name)
|
protected ResolvedConceptReference |
resolveConceptReference(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code)
|
protected ResolvedConceptReference |
resolveConceptReference(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
int resolveAssociationDepth,
int resolveCodedEntryDepth)
|
protected ResolvedConceptReference |
resolveConceptReference(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
int resolveAssociationDepth,
int resolveCodedEntryDepth,
boolean direction)
|
protected ResolvedConceptReference |
resolveConceptReference(java.lang.String codingScheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String code,
java.util.Vector properties,
int resolveAssociationDepth,
int resolveCodedEntryDepth,
boolean direction,
java.lang.String relation)
|
protected CodedNodeSet |
restrictToSource(CodedNodeSet cns,
java.lang.String source)
|
java.util.Vector<CodedEntry> |
searchCodedEntries(java.lang.String scheme,
java.lang.String version,
java.lang.String tag,
java.lang.String searchTerm,
int limit,
java.lang.String source,
boolean cui,
boolean shortResult,
boolean score)
|
int |
toActionIndex(java.lang.String action)
|
LocalNameList |
vector2LocalNameList(java.util.Vector v)
Converts a LocalNameList instance to a Vector |
Methods inherited from class java.lang.Object |
---|
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait |
Field Detail |
---|
protected org.LexGrid.LexBIG.LexBIGService.LexBIGService lbSvc
public org.LexGrid.LexBIG.Utility.ConvenienceMethods lbConvMethods
public CodingSchemeRenderingList csrl
protected java.util.Vector<CodingScheme> supportedCodingSchemes
public static final int RESTRICT_TO_TARGET
public static final int RESTRICT_TO_SOURCE
public static java.lang.String ROOT_ASSOCIATION
public static java.lang.String ROOT_ROLE
public static java.lang.String ASSOCIATION_RELATION
public static java.lang.String ROLE_RELATION
public static java.lang.String TYPE_DEFINITION
public static java.lang.String TYPE_COMMENT
public static java.lang.String TYPE_PROPERTY
public static java.lang.String TYPE_INSTRUCTION
public static java.lang.String TYPE_PRESENTATION
protected java.lang.String version
protected java.lang.String tag
protected java.lang.String codingScheme
protected CodingScheme defaultCodingScheme
Constructor Detail |
---|
public DLBWrapper()
public DLBWrapper(EVSApplicationService lbSvc)
Method Detail |
---|
public Logger getLogger()
protected java.util.Vector arrayToVector(java.lang.Object[] objects)
objects
- an array of objects
protected java.util.Vector<java.lang.String> hashSet2Vector(java.util.HashSet hset)
hset
- a HashSet instance
public LocalNameList vector2LocalNameList(java.util.Vector v)
v
- a Vector
public java.util.HashSet<java.lang.String> LocalNameList2HashSet(LocalNameList list)
list
- an instance of LocalNameList
public static ConceptReference createConceptReference(java.lang.String code, java.lang.String codingSchemeName)
codingSchemeName
- a coding scheme namecode
- a concept code
public CodingSchemeVersionOrTag createCodingSchemeVersionOrTag(java.lang.String version, java.lang.String tag)
version
- coding scheme versiontag
- coding scheme tag
public NameAndValue createNameAndValue(java.lang.String name, java.lang.String value)
name
- a namevalue
- a value
public java.util.Vector<CodingScheme> getSupportedCodingSchemes()
public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedCodingSchemeNames()
public CodingScheme getCodingScheme(java.lang.String codingScheme)
codingScheme
- a coding scheme name
public CodingScheme getCodingScheme(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme version
public CodingScheme getCodingScheme(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- a coding scheme tag
public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedSearchTechniques()
public java.lang.String getSearchTechniqueDescription(java.lang.String name)
name
- search technique name
public java.util.Vector<java.lang.String> getAvailableCodingSchemeVersions(java.lang.String codingSchemeName)
codingSchemeName
-
public java.lang.String getCopyRight(CodingScheme cs)
cs
- an instance of CodingScheme
public java.util.Vector getSources(CodingScheme cs)
cs
- an instance of CodingScheme
public java.util.Vector<java.lang.String> getVersions(CodingScheme cs)
cs
- an instance of CodingScheme
protected CodingSchemeVersion getCodingSchemeVersion(CodingScheme cs, java.lang.String version)
cs
- an instance of CodingSchemeversion
- a coding scheme version
public java.util.Date getVersionDate(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionpublic java.lang.Boolean isVersionComplete(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionpublic java.util.Vector<java.lang.String> getAvailableCodingSchemeTags(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionpublic java.lang.String getVocabularyVersionByTag(java.lang.String codingScheme, java.lang.String tag)
public java.util.Vector<SupportedProperty> getSupportedProperties(CodingScheme cs)
cs
- public java.util.Vector<SupportedSource> getSupportedSources(CodingScheme cs)
public java.util.Vector<SupportedProperty> getSupportedProperties(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedPropertyNames(CodingScheme cs)
cs
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedPropertyNames()
public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedPropertyNames(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedRepresentationalForms(CodingScheme cs)
cs
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedRepresentationalForms(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedConceptStatus(java.lang.String codingScheme)
codingScheme
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedConceptStatus(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- protected ResolvedConceptReference resolveConceptReference(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- protected ResolvedConceptReference resolveConceptReference(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, int resolveAssociationDepth, int resolveCodedEntryDepth)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- properties
- resolveAssociationDepth
- resolveCodedEntryDepth
- protected ResolvedConceptReference resolveConceptReference(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, int resolveAssociationDepth, int resolveCodedEntryDepth, boolean direction)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- properties
- resolveAssociationDepth
- resolveCodedEntryDepth
- direction
- protected ResolvedConceptReference resolveConceptReference(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, int resolveAssociationDepth, int resolveCodedEntryDepth, boolean direction, java.lang.String relation)
public boolean conceptExists(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- protected java.lang.Boolean conceptExists(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, boolean activeOnly, java.lang.String code)
protected NameAndValueList createNameAndValueList(java.lang.String[] names, java.lang.String[] values)
protected java.lang.Boolean isCodeInGraph(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String associationName, java.lang.String associationQualiferName, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- associationName
- associationQualiferName
- code
- protected java.util.Vector<CodedEntry> getAllConcepts(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, boolean activeOnly, java.util.Vector sortproperties, java.util.Vector properties, int maxToReturn)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- activeOnly
- sortproperties
- properties
- maxToReturn
- protected java.util.Vector<NameAndValue> getConceptProperties(CodedEntry ce)
ce
- protected CodedEntry findCodedEntryWithNameMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String name)
protected java.util.Vector<java.lang.String> mapSynonymsToPreferredNames(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String matchText, boolean preferredOnly, java.util.Vector sortByProperty_vec, int maxToReturn, java.lang.String matchAlgorithm)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionmatchText
- preferredOnly
- sortByProperty_vec
- maxToReturn
- matchAlgorithm
- public java.lang.String getConceptStatus(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- public java.lang.Boolean isConceptActive(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- public java.lang.Boolean isConceptActive(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- public java.lang.Boolean isCodeRetired(java.lang.String codingSchemeName, java.lang.String code)
protected java.util.Vector<CodedEntry> getConceptsByKind(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, boolean activeOnly, java.lang.String kind, int maxToReturn)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- activeOnly
- kind
- maxToReturn
- public java.util.Vector<java.lang.String> getRelationNames(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionpublic java.lang.String getInverseName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String relationName, java.lang.String associationName)
public java.util.Vector<java.lang.String> getAssociationNamesByRelation(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String relationName)
public boolean hasRelation(java.lang.String codingSchemeName, java.lang.String relationName)
public boolean hasRelation(java.lang.String codingSchemeName, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String relationName)
public java.util.Vector<java.lang.String> getAssociationNamesByRelation(CodingScheme cs, java.lang.String relation)
protected java.lang.String getNativeRelationName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionpublic java.lang.Boolean hasAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, boolean direction, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- direction
- associationName
- public java.util.Vector<CodedEntry> getAssociationSources(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- associationName
- public java.util.Vector getAssociationSources(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- properties
- associationName
- public java.util.Vector getAssociationTargets(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- associationName
- public java.util.Vector getAssociationTargets(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- properties
- associationName
- public java.util.Vector<CodedEntry> getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- associationName
- public java.util.Vector<CodedEntry> getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, boolean direction, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- direction
- associationName
- public java.util.Vector<CodedEntry> getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, boolean direction, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- properties
- direction
- associationName
- public java.util.Vector getAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.lang.String relation)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- relation
- public java.util.Vector<AssociatedConcept> getAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.lang.String relation, boolean direction)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- relation
- direction
- public java.util.Vector<java.lang.String> getAssociationNames(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, boolean direction)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- direction
- public java.lang.Boolean hasAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, boolean direction, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- properties
- direction
- associationName
- public java.lang.Boolean areAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code1, java.lang.String code2, boolean direction, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme namecode1
- code2
- direction
- associationName
- public java.lang.Boolean areAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code1, java.lang.String code2, boolean direction, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code1
- code2
- direction
- associationName
- public java.lang.Boolean isCodeInGraph(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- public java.lang.Boolean areCodesRelated(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code1, java.lang.String code2, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code1
- code2
- associationName
- protected java.util.Vector<CodedEntry> getRelatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, boolean direction, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- direction
- associationName
- public java.util.Vector<java.lang.String> getCodesInCodedEntries(java.util.Vector w)
w
- protected boolean isRole(java.lang.String codingScheme, java.lang.String associationName)
public static java.util.Vector<Role> conceptAssociations2Roles(java.util.Vector<ConceptAssociation> asso)
asso
- a ConceptAssociationpublic java.util.Vector<Role> getRoles(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- public java.util.Vector<Role> getRoles(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.lang.String associationName)
public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- associationName
- public java.util.Vector<Role> getRoles(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.lang.String associationName)
public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.lang.String associationName)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- associationName
- public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedRoleNames(java.lang.String codingSchemeName)
public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedRoleNames(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version)
public java.util.Vector<Role> getRoles(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- public java.util.Vector getInverseRoles(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- public java.util.Vector getInverseConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
public java.util.Vector<ConceptAssociation> getInverseConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- public java.util.Vector getInverseRoles(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
public java.util.HashSet<java.lang.String> getRelationTypesForConcept(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- public java.util.Vector<CodedEntry> findCodedEntriesWithDesignationMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String matchText, boolean preferredOnly, java.util.Vector sortByProperty_vec, java.util.Vector source_vec, java.lang.String matchAlgorithm, int maxToReturn)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionmatchText
- preferredOnly
- sortByProperty_vec
- source_vec
- matchAlgorithm
- maxToReturn
- public java.util.Vector findCodedEntriesWithAssociation(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String associationName, java.lang.String matchAlgorithm, int maxToReturn)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionassociationName
- matchAlgorithm
- maxToReturn
- public java.util.Vector findCodedEntriesWithAssociationMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String matchText, java.lang.String associationName, java.lang.String matchAlgorithm, int maxToReturn)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionmatchText
- associationName
- matchAlgorithm
- maxToReturn
- public java.util.Vector findCodedEntriesWithAssociationMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String matchText, java.lang.String associationName, java.lang.String matchAlgorithm, int maxToReturn, int restriction_direction)
protected int getCNSSize(CodedNodeSet cns)
protected int getCNGSize(CodedNodeGraph cng)
public java.util.Vector findCodedEntriesWithAssociationMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String matchText, java.lang.String associationName, java.lang.String matchAlgorithm, int maxToReturn, int restriction_direction, java.util.Vector restricted_property_vec)
public java.util.Vector<CodedEntry> findCodedEntriesWithAssociationMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String matchText, java.lang.String associationName, java.lang.String matchAlgorithm, int maxToReturn, int restriction_direction, java.util.Vector restricted_property_vec, java.lang.String relationName)
protected CodedNodeGraph getTreeFromServer(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.lang.String relationName, java.util.Vector properties, java.util.Vector sourcecodes, java.util.Vector associations, boolean direction, int depth)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- relationName
- properties
- sourcecodes
- associations
- direction
- depth
-
protected int getChildCount(java.util.HashMap HashMap, java.lang.String code)
HashMap
- code
- public java.lang.String codeToName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- Code to be converted
public java.lang.String codeToName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- public java.lang.String codeToName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version_in, java.lang.String tag_in, java.lang.String code)
public CodedEntry getCodedEntryByCode(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- public java.lang.String getConceptName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- public java.lang.String nameToCode(java.lang.String codingScheme, java.lang.String name)
codingScheme
- a coding scheme namename
- NC_name to look up
ParameterException
InternalErrorException
public java.lang.String nameToCode(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version_in, java.lang.String tag_in, java.lang.String name)
codingScheme
- a coding scheme nameversion_in
- a coding scheme versiontag_in
- a coding scheme tagname
- concept namepublic CodedEntry getCodedEntryByName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String name)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionname
- public java.util.Vector<CodedEntry> findCodedEntriesWithPropertyMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String matchText, java.util.Vector property_vec, java.util.Vector restrictToProperties_vec, java.lang.String matchAlgorithm, int maxToReturn)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionmatchText
- property_vec
- restrictToProperties_vec
- matchAlgorithm
- maxToReturn
- public java.util.Vector<CodedEntry> findCodedEntriesWithPropertyMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String matchText, java.util.Vector property_vec, java.util.Vector restrictToProperties_vec, java.lang.String matchAlgorithm, int maxToReturn, java.lang.String language)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
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- property_vec
- restrictToProperties_vec
- matchAlgorithm
- maxToReturn
- language
- protected java.lang.String findDescription(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
-
LBException
public java.lang.String findConceptNameByCode(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- public java.util.Vector<java.lang.String> findRelatedCodes(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.lang.String relation, boolean direction)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- relation
- direction
- public java.util.Vector getAllAssociatedConcepts(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String code, boolean direction)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versioncode
- direction
- public java.lang.String getConceptName(java.lang.String codingScheme, CodedEntry ce)
codingScheme
- ce
- public CodedEntry getCodedEntry(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
protected LocalNameList atributeSetDescriptorIndex2LocalNameList(int ASD_Index)
public CodedEntry getCodedEntry(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, int ASD_Index)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- ASD_Index
- public java.util.Vector getRootCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionprotected CodedEntry getReferencedEntry(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, ResolvedConceptReference rcr)
public java.util.Vector<CodedEntry> getRootCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String relation, java.lang.String association)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionrelation
- association
- public java.util.Vector<CodedEntry> getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, boolean direction, java.lang.String associationName, int resolveAssociationDepth, int resolveCodedEntryDepth)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- code
- properties
- direction
- associationName
- resolveAssociationDepth
- resolveCodedEntryDepth
- public java.util.Vector<CodedEntry> getAssociatedCodedEntriesBySource(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.util.Vector properties, boolean direction, java.lang.String associationName, int resolveAssociationDepth, int resolveCodedEntryDepth, java.lang.String sourceAbbr)
public java.lang.Boolean hasAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String relationship, java.lang.String association, java.lang.String conceptCode, boolean direction)
codingScheme
- a coding scheme namerelationship
- association
- conceptCode
- direction
- public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String conceptCode, boolean direction)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionconceptCode
- direction
- public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String conceptCode, boolean direction, java.lang.String relation)
public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String conceptCode, boolean direction, boolean returncode)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versionconceptCode
- direction
- returncode
- public java.util.Vector<CodedEntry> getAssociatedCodedEntries(java.lang.String codingScheme, java.lang.String relationship, java.lang.String association, java.lang.String conceptCode, boolean direction, boolean buildReferencedEntries)
codingScheme
- a coding scheme namerelationship
- association
- conceptCode
- direction
- buildReferencedEntries
- public java.lang.Boolean codeExists(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- public boolean isValidHistoryDate(java.lang.String codingScheme, java.util.Date historydate)
public java.util.Vector<java.util.Date> getHistoryBaselineDates(java.lang.String codingScheme)
codingScheme
- a coding scheme namepublic java.util.Date getConceptCreationDate(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
public java.util.Vector<NCIChangeEvent> getConceptHistory(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- public java.util.Vector<NCIChangeEvent> getConceptHistory(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.util.Date beginDate, java.util.Date endDate)
public java.util.Vector<NCIChangeEvent> getConceptHistory(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, CodingSchemeVersion csv)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- csv
- public java.util.Vector<CodingSchemeVersion> getConceptChangeVersions(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- public CodingSchemeVersion getConceptCreateVersion(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
codingScheme
- a coding scheme namecode
- public java.util.Date getHistoryStartBaselineDate(java.lang.String codingScheme)
codingScheme
- a coding scheme namepublic java.util.Date getHistoryEndBaselineDate(java.lang.String codingScheme)
codingScheme
- a coding scheme namepublic java.util.Vector<java.util.Date> getConceptEditActionDates(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, int iAction)
protected java.lang.String iActiontoStr(int actionId)
actionId
-
public int toActionIndex(java.lang.String action)
protected java.lang.String dateToString(java.util.Date aDate)
public java.util.Vector<EditActionDate> getConceptEditAction(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code)
public java.lang.Boolean isConceptEdited(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, boolean mrg_splt, java.util.Date beginDate, java.util.Date endDate)
public java.lang.Integer getNumberEditActions(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.util.Date baselineDate_in)
public java.lang.Integer getNumberEditActions(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.util.Date beginDate, java.util.Date endDate)
public java.util.Vector<java.lang.String> getAncestorCodeActionDates(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode, java.util.Date iBaselineDate_in, java.util.Date fBaselineDate_in)
public java.util.Vector getCodeActionParents(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode, java.util.Date baselineDate_in)
public java.util.Vector getAncestorCodes(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode, boolean atBaseline, java.util.Date iBaselineDate_in, java.util.Date fBaselineDate_in)
public java.util.Vector<java.lang.String> getAncestorCodes(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode, boolean atBaseline, java.util.Date iBaselineDate_in, java.util.Date fBaselineDate_in, boolean split_merge_only)
public java.util.Vector<java.lang.String> getDescendantCodeActionDates(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode, java.util.Date iBaselineDate_in, java.util.Date fBaselineDate_in)
public java.util.Vector getCodeActionChildren(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode, java.util.Date baselineDate_in)
public java.util.Vector getDescendantCodes(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode, boolean atBaseline, java.util.Date iBaselineDate_in, java.util.Date fBaselineDate_in)
public java.util.Vector<java.lang.String> getDescendantCodes(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode, boolean atBaseline, java.util.Date iBaselineDate_in, java.util.Date fBaselineDate_in, boolean merge_split_only)
public java.util.Vector<java.lang.String> getAncestors(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode)
public java.util.Vector<java.lang.String> getDescendants(java.lang.String codingScheme, java.lang.String inCode)
public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedPropertyQualifier(java.lang.String codingScheme)
public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedAssociationQualifier(java.lang.String codingScheme)
public int getSupportedContextCount(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
public int getSupportedContextCount(CodingScheme cs)
public java.util.Vector getSupportedContext(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- public java.util.Vector<SupportedContext> getSupportedContext(CodingScheme cs)
public java.util.Vector getSupportedContextNames(CodingScheme cs)
public java.util.Vector getSupportedSource(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- a coding scheme nameversion
- a coding scheme versiontag
- public java.util.Vector<SupportedSource> getSupportedSource(CodingScheme cs)
public java.util.Vector getSupportedSourceNames(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
codingScheme
- version
- tag
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedSourceNames(CodingScheme cs)
public java.util.Vector<CodedEntry> findCodedEntriesWithSourceCodeMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String sourceAbbr, java.lang.String code, int maxToReturn)
public java.util.Vector<CodedEntry> findCodedEntriesWithSourceCodeMatching(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String sourceAbbr, java.lang.String code, int maxToReturn)
public static CodingSchemeVersionOrTag createProductionTag()
public static SortOption createSortOption(java.lang.String sortExtensionName, java.lang.Boolean ascending)
public static SortOptionList createSortOptionList(java.lang.String[] sortExtensionNames, java.lang.Boolean[] ascending) throws LBParameterException
LBParameterException
public static SortOptionList createSortOptionList(java.lang.String[] sortExtensionNames)
public java.lang.String getSemanticTypeCode(java.lang.String name)
public java.util.Vector<java.lang.String> getSemanticTypeCodes(java.util.Vector names)
public boolean initializeSemanticTypes()
public java.util.HashMap getSemanticTypes()
public int getChangeTypeNumber(java.lang.String s)
protected boolean hasProperty(java.lang.String codingScheme, java.lang.String property)
protected CodedNodeSet createCodeNodeSet(java.lang.String[] conceptCodes, java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag)
protected Association[] getChildrenOf(java.lang.String conceptCode, java.lang.String relationship, java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, boolean buildReferencedEntries)
protected Association[] getParentsOf(java.lang.String conceptCode, java.lang.String relationship, java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, boolean buildReferencedEntries)
public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String conceptCode, boolean direction, boolean returncode, boolean forTreeTraversal)
public java.util.Vector<ConceptAssociation> getConceptAssociations(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String conceptCode, boolean direction, boolean returncode, boolean forTreeTraversal, java.lang.String relation)
public java.util.Vector<SupportedAssociation> getSupportedAssociations()
public java.util.Vector<SupportedAssociation> getSupportedAssociations(CodingScheme cs)
cs
- public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedAssociationNames(java.lang.String codingScheme)
codingScheme
- a coding scheme nameprotected java.util.Set<java.lang.String> getTargetNames(ResolvedConceptReferenceList rcrl)
public java.util.Vector<java.lang.String> getSupportedAssociationNames(java.lang.String codingSchemeName, java.lang.String version, java.lang.String type)
public java.util.Vector getSupportedPropertyQualifiers(java.lang.String codingScheme)
public java.util.Vector<Property> convertProperties(org.LexGrid.commonTypes.Property[] properties)
public java.util.Vector<Property> getProperties(CodedEntry ce)
public java.util.Vector getPropertiesByCode(java.lang.String codingSchemeName, java.lang.String versionName, java.lang.String code)
public java.util.Vector<Property> getPropertiesByConceptName(java.lang.String codingSchemeName, java.lang.String versionName, java.lang.String tagName, java.lang.String conceptname)
public java.util.Vector<java.lang.String> getPropertyNames(CodedEntry ce)
public java.util.Vector<java.lang.String> getPropertyNames(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String conceptname)
public java.util.Vector<java.lang.String> getPropertyValues(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String conceptname, java.lang.String propertyname)
public java.util.Vector<java.lang.String> getPropertyValues(CodedEntry ce, java.lang.String propertyname)
public java.util.Vector<java.lang.String> getPropertySources(org.LexGrid.commonTypes.Property prop)
prop
- property name
public java.util.Vector<java.lang.String> array2Vector(java.lang.String[] a)
public java.util.Vector<java.lang.String> getFilterExtensions()
public java.util.Vector<Property> getConceptProperties(java.lang.String codingScheme, java.lang.String code, java.lang.String propertytype, java.lang.String propertyname)
public java.lang.String getHasSubtype(java.lang.String codingSchemeName)
public java.util.Vector<CodedEntry> searchCodedEntries(java.lang.String scheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String searchTerm, int limit, java.lang.String source, boolean cui, boolean shortResult, boolean score)
protected CodedNodeSet restrictToSource(CodedNodeSet cns, java.lang.String source)
public java.lang.String getPreferredName(CodedEntry ce)
public java.lang.String getName(java.lang.String codingSchemeName, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code)
public java.lang.String getName(CodedEntry ce)
public static ConceptReferenceList createConceptReferenceList(java.lang.String[] codes, java.lang.String codeSystem)
protected java.util.Vector<java.lang.String> getCodedEntrySources(CodedEntry ce)
public java.util.Vector<java.lang.String> getSourceCollectionbyCode(java.lang.String vocabularyName, java.lang.String code)
public java.lang.Boolean isForwardName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String directionalName)
public java.lang.Boolean isReverseName(java.lang.String codingScheme, java.lang.String version, java.lang.String directionalName)
public CodingSchemeSummary getCodingSchemeSummary(java.lang.String codingSchemeName, java.lang.String version)
public CodingSchemeSummary getCodingSchemeSummary(java.lang.String codingSchemeName)
public java.lang.String getRepresentsVersion(java.lang.String codingSchemeName)
protected java.util.Vector<AssociatedConcept> getSources(java.lang.String scheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.lang.String relation, java.lang.String source)
protected java.util.Vector<AssociatedConcept> getTargets(java.lang.String scheme, java.lang.String version, java.lang.String tag, java.lang.String code, java.lang.String relation, java.lang.String source)
public java.lang.Boolean isCodingSchemeActive(LexBIGService lbSvc, java.lang.String scheme, java.lang.String version)
|
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PREV CLASS NEXT CLASS | FRAMES NO FRAMES | |||||||||
SUMMARY: NESTED | FIELD | CONSTR | METHOD | DETAIL: FIELD | CONSTR | METHOD |